Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC-0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMG1Q96Q15 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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