Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRERF1Q96PN7 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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