Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SAMD8Q96LT4 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SAMD8Q96LT4 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SAMD8Q96LT4 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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SAMD8Q96LT4 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SAMD8Q96LT4 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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SAMD8Q96LT4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SAMD8Q96LT4 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SAMD8Q96LT4 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SAMD8Q96LT4 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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