Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KNOP1Q1ED39 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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