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| UPP1 | Q16831 | CSN1S2AP-201 | ENST00000451783 | 779 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC010099.1-201 | ENST00000455434 | 375 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-953P-201 | ENST00000459154 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| UPP1 | Q16831 | MRPS17P3-201 | ENST00000465453 | 385 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL353612.1-201 | ENST00000428769 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | EBAG9-210 | ENST00000620557 | 2186 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Z82195.2-201 | ENST00000612348 | 18351 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF680P1-201 | ENST00000436625 | 1469 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MGAT4C-210 | ENST00000620241 | 3194 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OGN-201 | ENST00000262551 | 2971 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR454-201 | ENST00000390180 | 115 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR5H8-201 | ENST00000394191 | 1045 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01737-201 | ENST00000412647 | 403 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL109913.1-201 | ENST00000421173 | 514 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01817-201 | ENST00000429317 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | C8orf59P1-201 | ENST00000429930 | 303 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL137789.1-201 | ENST00000439443 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | GPM6BP1-201 | ENST00000446387 | 144 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL162395.1-201 | ENST00000457882 | 422 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022364.2-201 | ENST00000457963 | 554 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC133134.1-201 | ENST00000466800 | 359 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC006512.1-201 | ENST00000468816 | 291 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02269-201 | ENST00000509968 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-506P-201 | ENST00000516553 | 94 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SPINK7-205 | ENST00000523535 | 299 nt | TSL 2 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CLEC2D-214 | ENST00000543300 | 399 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CLEC2D-216 | ENST00000545918 | 288 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC068135.2-201 | ENST00000569293 | 1028 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AF250324.2-201 | ENST00000608299 | 610 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC068792.1-201 | ENST00000621354 | 417 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC068544.1-201 | ENST00000635064 | 248 nt | TSL 5 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL512643.1-201 | ENST00000635735 | 524 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Z99571.1-201 | ENST00000636677 | 394 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | TMEM59-205 | ENST00000371348 | 1911 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | QSER1-204 | ENST00000527788 | 5052 nt | TSL 2 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | DNAH14-210 | ENST00000439375 | 13548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR4G2P-201 | ENST00000328113 | 903 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OSTN-201 | ENST00000339051 | 402 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |