Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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