Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SNAPC1Q16533 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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