Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNCBQ16143 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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