Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERC1Q15751 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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