Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SS18Q15532 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SS18Q15532 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms