Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RFTN1Q14699 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RFTN1Q14699 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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RFTN1Q14699 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFTN1Q14699 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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