Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SMC1AQ14683 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SMC1AQ14683 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SMC1AQ14683 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SMC1AQ14683 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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