Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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NEDD9Q14511 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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NEDD9Q14511 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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NEDD9Q14511 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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NEDD9Q14511 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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NEDD9Q14511 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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