Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL1Q13616 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL1Q13616 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms