Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
NAE1Q13564 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NAE1Q13564 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms