Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms