Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
C1orf61Q13536 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms