Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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MSLNQ13421 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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MSLNQ13421 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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