Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
AP3B2Q13367 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms