Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RIGQ13278 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RIGQ13278 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms