Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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