Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1AQ13111 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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