Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TFCP2Q12800 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TFCP2Q12800 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms