Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms