Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms