Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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