Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.4 ms