Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
USP18Q9UMW8 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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USP18Q9UMW8 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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USP18Q9UMW8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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USP18Q9UMW8 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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USP18Q9UMW8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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USP18Q9UMW8 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
USP18Q9UMW8 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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