Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MEIS3Q99687 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MEIS3Q99687 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms