Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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ZBED3Q96IU2 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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ZBED3Q96IU2 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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ZBED3Q96IU2 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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ZBED3Q96IU2 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ZBED3Q96IU2 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ZBED3Q96IU2 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZBED3Q96IU2 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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