Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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