Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ALX1Q15699 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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