Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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