Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE3CQ15386 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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