Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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