Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms