Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BECN1Q14457 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms