Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF2H2Q13888 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms