Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
APOFQ13790 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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