Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms