Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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ATP1A4Q13733 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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