Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms