Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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