Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CSTF3Q12996 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CSTF3Q12996 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms