Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNTN1Q12860 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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CNTN1Q12860 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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