Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRMP28827 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRMP28827 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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