Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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ERVV-2B6SEH9 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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ERVV-2B6SEH9 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERVV-2B6SEH9 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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