Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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