Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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SH3BP1Q9Y3L3 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SH3BP1Q9Y3L3 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SH3BP1Q9Y3L3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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