Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMG1Q96Q15 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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